路漫漫其修远兮
吾将上下而求索
刘洋
Yang LIU
传染病研究所
特聘研究员
liuy@szbl.ac.cn
Timeline
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2022 至今
深圳湾实验室 传染病研究所 特聘研究员
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2018-2021
美国德克萨斯大学医学分部 生物化学和分子生物学系 博士后
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2013-2018
清华大学生命科学院 生物学 博士
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2011-2013
清华大学 医学院 高级科研助理
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2008-2011
深圳北科生物科技有限公司 iPS研发 高级科研助理
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2007-2008
香港中文大学 生物系 科研助理
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2002-2006
复旦大学生命科学院 生物科学 学士
研究领域
课题组主要着眼于新发和再发病毒传染病的遗传进化和致病机理研究，以及新型抗病毒策略的研发。将运用反向遗传学，病毒学，免疫学，生物信息学和各种组学研究手段，寻找病毒上和宿主中影响病毒感染和传播的重要突变和关键因子，阐述其发挥作用的分子机制；并以这些病毒突变和宿主因子为靶点，研发新型抗病毒策略和治疗手段。同时，课题组将开发各种在低安全级别条件下进行烈性病毒基础研究，药物、抗体和疫苗筛选及评估的病毒工具；搭建高致病性病毒的通用疫苗平台，为各种病毒传染病的防控提供科技支撑。
成果
刘洋博士于2006年本科毕业于复旦大学，2018年在清华大学获得生物学博士学位。其研究聚焦重要人类致病病毒的遗传进化、致病机理及抗病毒策略的开发，鉴定出了登革病毒、寨卡病毒和新冠病毒上多个影响病毒感染和传播的重要因子，解析了这些病毒在自然界中的遗传进化规律。新冠疫情期间，刘洋博士搭建了多种研究新冠病毒的反向遗传学平台，首次评估了新冠疫苗对多种突变新冠病毒中和能力的变化，为新冠病毒疫苗策略的制定和改进提供了第一手信息。刘洋博士于2022年加入深圳湾实验室传染病所，任特聘研究员，获得华南理工大学/中山大学的博士生/硕士生导师资格。其归国后获得了2021年中华医学科技奖二等奖（第3完成人），2022年教育部科学技术奖一等奖（第4完成人）；获批2022年国家级高层次人才工程（青年）和其它多项国家基金项目。其研究成果以第一作者/通讯作者（含共同一作/通讯）的身份发表于Nature, NEJM, Cell, Nature Medicine, Nature Microbiology, Nature Communications 等国际知名期刊，累计影响因子达590，引用次数超4500次。
图一：在这项研究中，我们发现并验证了新冠病毒刺突蛋白上的第501位氨基酸从天冬酰胺到酪氨酸的突变，能显著增加新冠病毒和ACE2受体的结合，促进病毒的感染和传播。该项研究揭示了新冠病毒alpha毒株在2021年初在全球大规模流行的原因。
图二：这项研究使用反向遗传学手段，在世界上首次搭建了新冠突变病毒重组活病毒平台，检测了新冠疫苗免疫后的人群抗血清对不同变种的新冠病毒毒株中和能力的变化，为新冠病毒的疫苗的后续改进提供了重要的第一手信息。
图三：在这项研究中，我们发现寨卡病毒NS1蛋白上的第188位氨基酸从丙氨酸到缬氨酸的突变，会增加NS1蛋白在宿主血液循环系统中的分泌量。NS1蛋白会伴随着蚊虫吸血获取病毒时进入蚊虫体内，抑制蚊虫肠道的免疫系统，从而增加寨卡病毒对蚊虫的感染；导致自然界中携带病毒的蚊虫数目增加，促进了病毒的传播，从而引发了2017年寨卡病毒在南美洲的大规模爆发流行。
荣誉奖励
• 2021 中华医学会医学科学技术奖二等奖（第三完成人）
• 2018 吴瑞奖学金
• 2017 博士生国家奖学金
• 2017 第十二届全国病毒学学术研讨会，论文一等奖
• 2015 博士生国家奖学金
• 2014 清华大学一等奖学金
• 2013 清华大学迷你盖茨基金，一等奖
媒体报道
1. 人物 | 刘洋：三十年步履不停，从自然观察家到病毒学斗士
2. 新冠病毒变种和疫苗接种-BioArt与一作面对面(病毒篇第二期)
3. 新冠病毒的疫苗策略和接种
4. 新冠病毒的遗传进化之路
招聘信息
1. 博士后
2. 研究助理
代表论文
1. Liu Y*, Liu J*, Plante KS*, Plante JA, Xie X, Zhang X, Ku Z, An Z, Scharton D, Schindewolf C, Menachery VD, Shi PY and Weaver SC. The N501Y spike substitution enhances SARS-CoV-2 infection and transmission. Nature 602: 294–299 (2022).
2. Liu Y*, Zhang X*, Liu J*, Xia H*, Zou J, Muruato AE, Periasamy S, Kurhade C, Plante JA, Bopp NE, Kalveram B, Bukreyev A, Ren P, Wang T, Menachery VD, Plante KS, Xie X, Weaver SC and Shi PY. A live-attenuated SARS-CoV-2 vaccine candidate with accessory protein deletions. Nature communications 13: 4337 (2022)
3. Liu Y*, Liu J*, Zou J*, Kalveram B, Machado RR, Ren P, Türeli S, Smith DJ, Weaver, SC, Xie, X and Shi PY. Cross-neutralization and cross-protection among SARS-CoV-2 viruses bearing different variant spikes. Signal Transduction and Targeted Therapy 7: 285 (2022).
4. Liu Y*, Liu J*, Xia H, Zhang X, Fontes-Garfias CR, Swanson KA, Cai H, Sarkar R, Chen W, Cutler M, Cooper D, Weaver SC, Muik A, Sahin U, Jansen KU, Xie X, Dormitzer PR and Shi PY. Neutralizing activity of BNT162b2-elicited serum. New England Journal of Medicine 384: 1466-1468 (2021)
5. Plante JA*, Liu Y*, Liu J*, Xia H, Johnson BA, Lokugamage KG, Zhang X, Muruato AE, Zou J, Fontes-Garfias CR, Mirchandani D, Scharton D, Bilello JP, Ku Z, An Z, Kalveram B, Freiberg AN, Menachery VD, Xie X, Plante KS, Weaver SC and Shi PY. Spike mutation D614G alters SARS-CoV-2 fitness. Nature 592: 116-121 (2021).
