科学研究

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彭琴

Chance favors the prepared mind

彭琴

Qin PENG

系统与物理生物学研究所

特聘研究员

pengqin@szbl.ac.cn

课题组主页:http://pengqin.szbl.ac.cn/

Timeline

  • 2020 至今

    深圳湾实验室         特聘研究员

  • 2017-2020

    美国加州大学圣地亚哥分校         助理项目科学家

  • 2015-2017

    美国加州大学圣地亚哥分校         博士后

  • 2010-2015

    重庆大学-美国伊利诺伊大学香槟分校(UIUC)-美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)         联合培养博士

  • 2006-2010

    重庆大学         学士









研究领域


表观遗传学、生物力学、活细胞影像


研究方向:课题组主要从事染色质活细胞成像及基因表达调控机制的研究,开发针对肿瘤等疾病相关的表观遗传修饰引起的发病机制、诊断检测和治疗的成像工具,结合深圳湾实验室医工交叉的优势,从肿瘤的表观遗传调控机理和治疗等方面共同推进研究工作。

课题组具体研究方向为:

(1)开发活细胞表观遗传修饰与染色质的新型四维(4D)标记系统;

(2)研究染色质相分离机制以及开发基于相分离的分子互作成像系统;

(3)研究生物力学等理化信息和能量经表观分子互作的基因表达调控规律。






成果


合成了基于全长组蛋白的荧光能量共振转移(FRET)分子探针,实现了单个活细胞水平上一种或多种组蛋白修饰的实时动态成像示踪,阐明了有丝分裂开始时H3S10phH3K9me3去甲基化和染色质正确重塑的调控机制。并建立了基于定向进化技术(Directed Evolution的高通量筛选通用平台,用于更多FRET分子探针的构建。此外,耦合了基因编辑与荧光标记技术实时检测特定基因位点上的组蛋白修饰,进一步揭示了基因表达与细胞功能的调控关系。在PNAS、CELL CHEM BIOL(CELL子刊)SCI ADV (SCIENCE子刊)CURR OPIN SOLID ST MJ MOL BIOL等发表论文20余篇。


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荣誉


• 2008 重庆大学优秀学生

• 2009 黄乾亨基金奖学金

• 2010 重庆大学本科优秀毕业设计

• 2012-2014 国家公派联合培养奖学金

• 2016 UCSD Postdoc Travel Award






媒体报道


人物 | 彭琴:眼见为实,让FRET探针照亮四维核组学






招聘信息


  1. 1. 研究助理

  2. 2. 博士后

  3. 3. 副研究员/助理研究员






代表论文


1. Peng Q., Lu S., Shi Y., Pan Y., Limsakul P., Chernov AV., Qiu J., Chai X., Shi Y., Wang P., Ji Y.,Li YJ., Strongin AY., Verkhusha VV., Izpisua Belmonte JC., Ren B., Wang Y., Chien S., Wang Y. Coordinated Histone Modifications and Chromatin Reorganization in a Single Cell Revealed by FRET Biosensors. Proc Natl Acad Sci U S A. 2018, 115(50): E11681-E11690. DOI: 10.1073/pnas.

2. Limsakul P. *, Peng Q.*, Wu Y., Allen ME., Liang J., Remacle AG., Lopez T., Ge X., Kay BK.,Zhao H., Strongin AY., Yang XL., Lu S., Wang Y. Directed Evolution to Engineer Monobody for FRET Biosensor Assembly at Live-Cell Surface. Cell Chem Biol. 2018, 25(4): 370-379.e4. DOI: 10.1016/j.chembiol.2018.01.002. (* co-first author) 

3. Huang Z, Ouyang M., Lu S., Wang Y†, Peng Q.†. Optogenetic Control for InvestigatingSubcellular Localization of Fyn Kinase Activity in Single Live Cells. J Mol Biol. 2020, pii:S0022-2836(20)30236-9. DOI: 10.1016/j.jmb.2020.03.015. (†corresponding author) 

4. Harrison R., Weng K., Wang Y.†, Peng Q.†. Phase Separation and Histone Epigenetics in Genome Regulation. Curr Opin Solid St M. 2020, Accepted. (†corresponding author)

5. Li S., Yang D., Gao L., Wang Y.†, Peng Q.†. Epigenetic Regulation and Mechanobiology.Biophysics Reports. 2020, 6, 33-48. DOI: 10.1007/s41048-020-00106-x. (†corresponding author)