研究领域

本课题组的主要研究目标是揭示肿瘤发生的基因组学机制，并开发新一代肿瘤治疗方法。为实现这一目标，我们开发并利用新型功能基因组学技术，对肿瘤发生、转移和免疫治疗中相关细胞的基因组功能进行多层次地、系统性地分析，揭示这些过程的基因组学机制。以此为基础，我们将融合基因编辑、基因表达调控、表观遗传学编辑、及合成生物学等技术，开发精准调控靶细胞命运与功能的新型基因疗法，开创肿瘤免疫治疗的新局面。

⁃融合CRISPR基因组工程、新一代测序、及单细胞组学等手段，开发多维度的功能基因组学方法，以揭示多种疾病，特别是肿瘤发生与转移的基因组学机制；

⁃应用高通量功能基因组学技术，研究肿瘤细胞、免疫细胞、肿瘤微环境间的相互作用，寻找肿瘤治疗的新靶点；

⁃开发以多层次、网络化的方式精准调控靶细胞的基因组功能，并精准导向靶细胞命运与功能的新型基因疗法。

成果

于晨博士将CRISPR技术应用于细胞生物学，取得了一系列重要成果。以第一作者和共同第一作者在Cell Stem Cell、Blood、Cell Chemical Biology 等国际高水平期刊发表多篇论文。发表论文累计被引用超过1300次，取得中国专利和美国专利各一项。

⁃ 建立了小分子化合物药物与CRISPR工具协同作用的方法，在人类细胞中实现了高效的精确基因编辑；

⁃ 基于CRISPR activation技术，建立了一种高通量的方法，系统揭示了转录因子间相互作用与细胞命运转换间的因果关系。

代表性图片

‍‍荣誉‍‍

• 2018 Cell Stem Cell杂志年度最佳论文

• 2015 Cell Stem Cell杂志年度最佳论文

• 2010 北京大学康宁奖学金

招聘信息

1. 研究助理

2. 博士后

代表论文

1. C. Yu, S. Ding, Therapeutic strategies targeting somatic stem cells: Chemical approaches. Bioorganic & Medicinal Chemistry. 28, 115824 (2020).

2. Y. Liu*, C. Yu*, T. P. Daley*, F. Wang, W. S. Cao, S. Bhate, X. Lin, C. Still, H. Liu, D. Zhao, H. Wang, X. S. Xie, S. Ding, W. H. Wong, M. Wernig, L. S. Qi, CRISPR Activation Screens Systematically Identify Factors that Drive Neuronal Fate and Reprogramming. Cell Stem Cell. 23, 758-771.e8 (2018).(*co-first author)

3. K. Liu*, C. Yu*, M. Xie*, K. Li, S. Ding, Chemical Modulation of Cell Fate in Stem Cell Therapeutics and Regenerative Medicine. Cell Chemical Biology. 23, 893–916 (2016). (*co-first author)

4. C. Yu, Y. Liu, T. Ma, K. Liu, S. Xu, Y. Zhang, H. Liu, M. La Russa, M. Xie, S. Ding, L. S. Qi, Small Molecules Enhance CRISPR Genome Editing in Pluripotent Stem Cells. Cell Stem Cell. 16, 142–147 (2015).

5. Y. Zhang, N. Cao, Y. Huang, C. I. Spencer, J. Fu, C. Yu, K. Liu, B. Nie, T. Xu, K. Li, S. Xu, B. G. Bruneau, D. Srivastava, S. Ding, Expandable Cardiovascular Progenitor Cells Reprogrammed from Fibroblasts. Cell Stem Cell. 18, 368–381 (2016).