2024-03-21
2024年3月19日,深圳湾实验室系统与物理生物学研究所李磊与西湖大学谢琦及匹兹堡大学Jeremy N. Rich团队在Cell Discovery 杂志发表题为“RBBP6 maintains glioblastoma stem cells through CPSF3-dependent alternative polyadenylation”的研究论文。该研究利用体内结合体外的CRISPR-Cas9筛选策略,发现泛素连接酶RBBP6通过调控选择性多聚腺苷酸化促进胶质母细胞瘤干细胞(glioblastoma stem cell, GSC)的增殖、自我更新及肿瘤生长。这项研究确定了RBBP6调控选择性多聚腺苷酸化影响MYC的表达,靶向RBBP6-CPSF3轴,可以抑制胶质母细胞瘤的生长,为胶质母细胞瘤的潜在治疗靶点提供了支持。
2024-02-04
在此平台基础上,作者通过化学半合成制备了商品化药物脱氢膜海鞘素B,解决了目前其化学合成繁琐、收率低的问题。此外,作者又通过化学半合成制备了膜海鞘素衍生物,进行了构效关系研究,阐明了主环羟基对活性的重要性。最后,作者通过化学半合成制备膜海鞘素分子探针,对膜海鞘素的作用机制进行了探究,验证了PPT1为其抑制癌细胞生长的一个可能的作用靶点。这一工作可能为结构复杂的天然产物研究提供一个新的范例。
2024-01-25
近日,深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心(以下简称“坪山中心”)|北京大学深圳研究生院(以下简称“北大深研院”)李子刚/尹丰课题组开发了一种基于吡啶盐的多肽/蛋白质可逆化学修饰方法学。该成果已发表在J. Am. Chem. Soc. 上,标题为“Traceless Peptide and Protein Modification via Rational Tuning of Pyridiniums”。
2024-01-02
12月20日,深圳湾实验室神经疾病研究所客座教授Nobuhiko Yamamoto(山本亘彦)、大阪大学大学院前沿生命机能研究科研究生Yuri Atsumi和特聘副教授Noriyuki Sugo领导的研究小组在Cell Reports上发表了题为"Repetitive CREB-DNA interactions at gene loci predetermined by CBP induce activity-dependent gene expression in human cortical neurons "的论文。在这项研究中,他们利用单分子成像技术揭示了人源干细胞诱导的神经元中 cAMP 反应元件结合蛋白(CREB)和 CREB 结合蛋白(CBP)的时空动态变化特征,发现神经元活动诱导 CREB-CBP 在特定基因位点重复出现,而这些基因位点是由 CBP 组蛋白乙酰转移酶活性预先决定的。
2023-11-16
2023年11月9日,浙江大学林世贤/芝加哥大学何川/深圳湾实验室葛韵团队合作在Nature Cell Biology上发表题为O-GlcNAcylation determines the translational regulation and phase separation of YTHDF proteins的研究论文。该研究采用翻译后修饰的化学定量检测技术,解析了O-GlcNAc修饰水平对YTHDF蛋白的翻译促进功能与相分离性质的调控机制,提出了YTHDF1/3可逆调控m⁶A-RNA翻译的完善模型,解释了YTHDF蛋白功能研究争议的本质原因。
2023-03-06
发展了在活细胞内“关联解析”蛋白质化学修饰机制与功能的“单位点-多组学”技术-SiTomics,揭示了受染色质酰化修饰介导的丰富的相互作用组学信息,建立了表观遗传调控的蛋白质组与基因组“信息关联”。