2024-03-06
深圳湾实验室系统与物理生物学研究所李磊团队与合作者近期在Nature Communications发表两篇研究论文。一篇为“A distinct class of pan-cancer susceptibility genes revealed by alternative polyadenylation transcriptome-wide association study”开发了一种全新的APA全转录组关联分析方法,识别了一类独特的肿瘤易感基因。另一篇为“Immune-response 3′UTR alternative polyadenylation quantitative trait loci contribute to variation in human complex traits and diseases”,首次报告免疫应答3′非翻译区选择性多聚腺苷酸化(APA)关联遗传位点可以解释人类复杂疾病。这两项研究为我们深入了解非编码区域变异在癌症发生、进展中功能提供了重要线索,也为鉴定复杂疾病风险易感基因提供新的视角。
2024-02-04
在此平台基础上,作者通过化学半合成制备了商品化药物脱氢膜海鞘素B,解决了目前其化学合成繁琐、收率低的问题。此外,作者又通过化学半合成制备了膜海鞘素衍生物,进行了构效关系研究,阐明了主环羟基对活性的重要性。最后,作者通过化学半合成制备膜海鞘素分子探针,对膜海鞘素的作用机制进行了探究,验证了PPT1为其抑制癌细胞生长的一个可能的作用靶点。这一工作可能为结构复杂的天然产物研究提供一个新的范例。
2024-01-25
近日,深圳湾实验室坪山生物医药研发转化中心(以下简称“坪山中心”)|北京大学深圳研究生院(以下简称“北大深研院”)李子刚/尹丰课题组开发了一种基于吡啶盐的多肽/蛋白质可逆化学修饰方法学。该成果已发表在J. Am. Chem. Soc. 上,标题为“Traceless Peptide and Protein Modification via Rational Tuning of Pyridiniums”。
2024-01-02
12月20日,深圳湾实验室神经疾病研究所客座教授Nobuhiko Yamamoto(山本亘彦)、大阪大学大学院前沿生命机能研究科研究生Yuri Atsumi和特聘副教授Noriyuki Sugo领导的研究小组在Cell Reports上发表了题为"Repetitive CREB-DNA interactions at gene loci predetermined by CBP induce activity-dependent gene expression in human cortical neurons "的论文。在这项研究中,他们利用单分子成像技术揭示了人源干细胞诱导的神经元中 cAMP 反应元件结合蛋白(CREB)和 CREB 结合蛋白(CBP)的时空动态变化特征,发现神经元活动诱导 CREB-CBP 在特定基因位点重复出现,而这些基因位点是由 CBP 组蛋白乙酰转移酶活性预先决定的。
2023-11-16
2023年11月9日,浙江大学林世贤/芝加哥大学何川/深圳湾实验室葛韵团队合作在Nature Cell Biology上发表题为O-GlcNAcylation determines the translational regulation and phase separation of YTHDF proteins的研究论文。该研究采用翻译后修饰的化学定量检测技术,解析了O-GlcNAc修饰水平对YTHDF蛋白的翻译促进功能与相分离性质的调控机制,提出了YTHDF1/3可逆调控m⁶A-RNA翻译的完善模型,解释了YTHDF蛋白功能研究争议的本质原因。
2023-03-06
发展了在活细胞内“关联解析”蛋白质化学修饰机制与功能的“单位点-多组学”技术-SiTomics,揭示了受染色质酰化修饰介导的丰富的相互作用组学信息,建立了表观遗传调控的蛋白质组与基因组“信息关联”。