科学研究

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李磊

汇天下英才 建世界舞台

李磊

Lei LI

系统与物理生物学研究所

特聘研究员

lilei@szbl.ac.cn

课题组主页:http://bioinfo.szbl.ac.cn/index.html

Timeline

  • 2021至今

    深圳湾实验室         特聘研究员

  • 2019-2020

    加州大学尔湾分校         研究助理教授

  • 2016-2019

    美国贝勒医学院         博士后

  • 2013-2016

    德国维尔茨堡大学医学院         博士后

  • 2009-2013

    香港中文大学         博士









研究领域


计算生物和疾病基因组学课题组主要通过运用和开发新的计算学方法,整合多种高通量组学大数据来解析人类复杂疾病和性状的遗传和表观遗传的调控机理,以期识别潜在的可运用于临床实践的分子标记及治疗靶点。






成果


首次开发创新计算生物学方法从公共大数据中发现基于选择性多聚腺苷酸化的分子表型并揭示了与复杂疾病的关系. 另外发现一类全新肿瘤特异性泛素连接酶可以在不同肿瘤类型驱使基因的广泛3'UTR缩短, 从而影响在肿瘤发生过程中的致癌机理。开发算法软件和数据库4个。发表论文30余篇包括7篇发表在Nature,Cell子刊。在过去5年中,论文共被他引>1000余次,H-index=17。多篇文章被Nature Reviews Cancer, Molecular Cell, F1000, BioArt等撰文推荐或封面报道并申请专利一项。目前担任Molecular Psychiatry,Nucleic Acids Research等期刊的审稿人与编委。受邀在多个国际会议包括美国人类遗传学年会作学术报告并指导多位博士研究生。






荣誉


• 2012年 香港中文大学Travel Award

• 2019年 美国人类遗传学协会年会口头报告

• 2020年 美国人类遗传学协会年会Reviewer' s Choice Abstract Award






媒体报道


Molecular Cell | 李磊博士等揭示肿瘤选择性多聚腺苷酸化的新机制 






招聘信息


  1. 1. 研究助理

  2. 2. 博士后

  3. 3. 副研究员/助理研究员






代表论文


1. Li L, Huang K, Gao YP, Cui Y, Wang G, Nathan D, Li YM, Chen YE, Ji P, Peng F, William K, Wagner EJ, Li W. (2021) An atlas of alternative polyadenylation quantitative trait loci contributing to complex trait and disease heritability. Nature Genetics. doi: 10.1038/s41588-021-00864-5. 

2. Li L*, Li YM, Zou XD, Peng FD, Cui Y, Eric JW, Li W. (2021) Population-Scale Genetic Control of Alternative Polyadenylation and its Association with Human Diseases. Quantitative Biology. doi: 10.15302/J‐QB‐021‐0252. (*corresponding author)

3. Yang SW^, Li L^, Connelly JP, Porter SN, Kodali K, Gan HY, Park JM, Tacer KF, Tillman H, Peng JM, Shondra MP, Li W, Potts PR. (2020) A Cancer-Specific Ubiquitin Ligase Drives mRNA Alternative Polyadenylation by Ubiquitinating the mRNA 3′ End Processing Complex. Molecular Cell, 77(6): 1206-1221. (^co-first author)

4. Feng X^, Li L^, Wagner EJ, Li W. (2018) TC3A: The Cancer 3′ UTR Atlas. Nucleic Acids Research, 46(D1): 1027–1030. (^co-first author)

5. Li L, Huang D, Cheung MK, Nong W, Huang Q, Kwan HS. (2013) BSRD: a repository for bacterial small regulatory RNA. Nucleic Acids Research, 41(D1): 233-238.